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第一个服务:UMLS查询

第一个服务:UMLS查询

UMLS本身的数据库有点乱,而且我们只需要利用到其中的一部分数据.

考虑两个实体:CUI,AUI,逻辑主键,重构结构.
关键用表: mrconso,mrdef, mrsty, mrhier,mrrel

Danel在画数据库图,和danel讨论了UMLS数据库,对我而言,也进一步加深了理解.感兴趣的同道,也可以和我们一起学习一下UMLS的表结构.

完成数据库的优化和重构之后,计划写好查询的类和一些方法.比如getCUI(String keyword), getCUI(String keyword, "SNOMEDCT").

然后学习使用SOAP的方法, client以http post发送request,包括方法和参数,server接受,执行,返回结果也以XML返回,完成第一个服务.然后就要看junhui的portlet进度.可以试试看绑定在jboss上面.

二期的服务,包括把一期查询的结果,存储到owl里面,实现UMLS到owl的转化.

优点:
实现一个UMLS重构的方法学,适用于以后的UMLS版本.
实现了UMLS到ontology的转换.
选咖啡,选拿铁.少喝咖啡,多办事

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小心啊
最好是不是先认清UMLS是什么
也许是杞人忧天吧
祝好运
LOINC International @ Regenstrief Institute
CLISOL @ CHISS
LOINC Introduction @ OpenClinical
LexGrid Project @ Mayo

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呵呵,用了四年,还算有些粗浅的认识。不过的确内容比较庞杂。不知linforest对loinc在UMLS里面的字段,和结构,可有和看法或者建议?对我们也是很好的帮助。检验的内容,我们还没有想好如何处理。
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