有朋友知道哪里有蛋白质名称缩写、全名及其别名的集合么？
interpro的database中只有蛋白质全名而没有别名；uniprot的记录单位只到达蛋白亚基的层次，缺少蛋白质整体的名称。

本人想开发一个pubmed的文本挖掘工具，无奈在这一关上过不去了，想听各位高见。

蛋白质的基本组成单位—氨基酸吗？缩写和全名不难，别名应该也不多。如果是对氨基酸进行各种修饰，可能要复杂很多。

试一试Gene Ontology（GO），不知道行不行。按道理基因编码蛋白质，既然是个本体，必然要涉及到基因转录和翻译的产物

Gene Ontology的cellular conponents中确实有蛋白的名称集合